O programa de investigação do Laboratório de Biomecânica e Morfologia Funcional desenvolve-se em três pilares, que se integram mutuamente.
O primeiro prende-se com o desenvolvimento de metodologias de análise de movimento e de avaliação in vivo das propriedades mecânicas fundamentais dos tecidos biológicos e a integração das variáveis biomecânicas obtidas em modelos computacionais (in Silico) que têm potencial de estimativa de cargas internas no sistema músculo-esquelético e capacidade de simulação biomecânica.
O segundo traduz-se pela aplicação prática dos modelos e métodos atrás referidos para o estudo dos fatores biomecânicos determinantes da performance desportiva, da determinação dos mecanismos de lesão desportiva e da sua prevenção bem como a determinação das condições de retorno ao treino e à competição.
O terceiro pilar corresponde à utilização de metodologias indiretas de avaliação e monitorização da carga mecânicas associadas ao desenho e supervisão de programas de intervenção tendentes a otimizar a funcionalidade motora e qualidade de vida de populações específicas.